По порядку:
Як-40, в девичестве Ан-Бе-20 (см фото), разрабатывался на замену самолётам Ли-2 и Ил-14 для полётов в Арктике и на аэродромы без твёрдого покрытия. Именно из этих соображений была заложена прочность, прочное и тяжёлое шасси и выбрана потребная тяга.

Сначала сыграла наша вечная проблема - отсутствие выбора двигателей для гражданской авиации. Двух нужной тяги не было - поставили три.
Потом выяснилось, что аэродромы без покрытия Як-40 может использовать только в идеальных условиях (читай книгу).
Як-40 приобрёл кличку "истребитель". Не за красоту и маневренность, а за способности по истреблению керосина. Даже в советские времена это было очень заметно. Убытка эксплуатация Як-40 приносила примерно столько же, сколько прибыли - вчетверо больший Ту-154.
Поднять Як-40 снова можно, для этого нужно:
- провести инспекцию конструкции каждого. С учётом того, что документация бумажная и старая, знающих машину специалистов не осталось - стоить будет очень дорого.
- заменить двигатели на импортные, потому что подходящего отечественного по-прежнему нет
- заново сертифицировать аппарат

- дождаться роста активности локального бизнеса, потому что только и именно это может сделать местную авиацию востребованной.

P.S. СибНИА, безусловно, молодцы, для серийного производства ни МС, ни переделка Ан-2 не годятся, но как работа исследовательского института - прекрасно.

На бумаге, по предварительным расчетам все всегда гладко и просто. На деле проще пустить все на металлом и купить те же самые "Бомбардье" и не морочить голову ни себе ни людям.