"...Неоспоримо, что в Манускрипте приведён текст на неизвестном языке..."
__________________
Не факт. Возможно, текст просто сгенерирован случайно. Известно много алгоритмов генерации, результат которых удовлетворяет закону Ципфа.

Текст, подчиняющийся закону Ципфа, получается, например, при применении решеток Кардано, которые широко использовались в то время. Кроме того закон Ципфа наблюдается в явлениях, вообще не связанных с языком и текстами. Есть мнение, что это просто артефакт статистики. По крайней мере ни одной внятной теории у закона Ципфа на данный момент нет.
Довод про графологов вообще не понял. Если я буду писать книгу на выдуманном языке выдуманными буквами, то очевидно, что в процессе написания почерк у меня станет беглым и точным.

"...специалист, по начертанию иероглифов, всё равно поймёт, что текст написан не японцем..."
__________________
Потому, что его можно сравнить с текстами, которые написали японцы носители языка. А тут сравнивать не с чем. Как можно определить, что буквы написаны с отклонениями, если никто никогда не видел, как их надо писать правильно.
__________________
"...Такого объёма явно недостаточно для выработки столь устойчивого почерка...."
__________________
Если только это не десятая по счету подобная книга, написанная автором.
__________________
".... Что наиболее вероятно: изощрённая по своей сложности мистификация или неизвестный (забытый) язык?..."
__________________
Неизвестный письменный язык в Европе 15 века? Скорее это одна из тех книг, которые использовали в качестве реквизита всякие бродячие лекари, колдуны и прочие шарлатаны, с целью пускать пыль в глаза клиентам. Такие книги известны, хотя конечно они отличаются от рукописи Войнича. Но я скорее предположу, что кто-то заказал себе особый реквизит, чем то, что в Европе в эпоху позднего средневековья существовал некий совершенно неизвестный ныне язык с уникальной системой письменности, от которого сохранился один единственный памятник.
__________________
"...Египетские иероглифы до Шампольона и письменность Майя до Кнорозова были для нас такой же загадкой...."
__________________
Неизвестные языки конечно были и есть. Но тут два момента. Во-первых, такие неизвестные языки либо очень древние, то есть носители жили задолго до начала исследования этого языка (как упомянутый Вами египетский), либо очень "далекие", то есть носители жили за пределами Ойкумены западной цивилизации (как упомянутый Вами язык Майя). А в данном случае нас пытаются убедить, что такой неизвестный язык якобы существовал в средневековой Европе (то, что рукопись Войнича имеет европейское происхождение, также как ее датировка, сомнению не подлежат).
А во-вторых, и египетский язык и язык Майя, и много других языков имеют множество письменных памятников: книги, переписка, различные бытовые предметы и украшения с надписями, высеченные на камне надписи и т.д. Конечно, есть совсем уж древние письменные языки, известные нам сегодня только по одному-двум найденным археологическим артефактам. Но это опять-таки крайне трудно представить для европейского языка, на котором писались книги в историческую эпоху.