"Самолет усилили по советским нормам прочности", - это было сделано сразу, при переделке конструкции DC-3 в ПС-84, под руководством сначала Мясищева, потом - Лисунова.

"вверху установили турель с 12,7-мм универсальным пулемётом Березина, в полу прорезали люк и смонтировали самодельные створки, а в грузовом отсеке соорудили конструкцию, на которую установили кассетные бомбодержатели."

Нет, это было потом, и на заводе. Сначала прямо в аэродромных мастерских (ПАРМ) на самолёт под фюзеляжем устанавливали бомбовые замки, а снаружи на фюзеляже возле места штурмана - бомбовый прицел НКПБ-4. Для бомбометания штурман должен был открыть форточку и высунуться. И высовывались, и бомбили! 2 тонны бомб - это очень даже достойная загрузка по тем временам. Зато такая установка позволяла использовать самолёт и как бомбардировщик, и как транспортный. Ли-2 с бомболюками и внутренним подвесом бомб как транспортный использоваться не мог.
То же самое с оборонительным вооружением. На аэродромах ставили 2 ШКАСа в лючках по бортам грузового отсека, на шкворневых установках ШКУ-1. На заводе, кроме того, сверху на фюзеляже ставили экранированную турель МВ-3 конструкции Веневидова и Можаровского с пулемётом ШКАС, потом, когда наладилось производство крупнокалиберных пулемётов, турель УТК-1 конструктора Шебанова под пулемёт УБТ.
К середине войны, когда механики аэродромных мастерских набрались опыта и наглости, на Ли-2 прямо на аэродромах начали монтировать турели других типов, снятые с разбитых бомбардировщиков, в том числе и с пушками ШВАК.