Бросали штандарты третьего рейха и прусской королевской армии.
Флаги кайзера я там не видел.

Важный момент: в Европейских армиях у Знамени "выдающийся внешний вид"(с) - это следствие исторического долголетия и успешности в сражениях.
"Среди отобранных флагов оказалось 20 кайзеровских штандартов. Вероятно, члены комиссии не знали о решении Гитлера прервать преемственность вермахта от кайзеровской армии, и эти знамена были выбраны за выдающийся внешний вид."(c) ну не надо же так принижать советскую разведку и Генеральный штаб, все всё прекрасно знали, тем более, решение аДольфа было публичным, да и архивы Вермахта и СС были захвачены в достаточных объемах.
И о планах союзничков тоже были прекрасно осведомлены, потому и легли самые важные знамена кайзеровской армии наравне с вермахтовскими и СС-вскими.
Есть очень хорошая книга по истории геральдики. Написанная англичанами после Первой мировой. Там, в основе, идет обзор развития рыцарских гербов и армейских знамен и штандартов. Но там же расписываются понятия чести и бесчестья гербов, штандартов и знамен. Кому интересно могут найти тему и почитать самостоятельно.
По простому Знамя - это символ вокруг которого собирается армия. Союзничики собрали пленных Вермахта в лагеря, только не в трудовые, как в СССР, и планировали использовать этих военнопленных именно как солдат (догадайтесь против кого). А солдатам нужен символ.
Использовать гитлеровские знамена нельзя - символ не тот, вермахтовские - не лучший вариант, да и в частях копии хранились, а вот кайзеровские это да - многие опытные германские офицеры воевали именно под этими знаменами в Первую мировую. Только почти все знамена (и кайзеровские и оригиналы вермахтовских) попали в СССР (Берлин-то наши взяли).
По геральдическим и армейским понятиям - потеря знамени - бесчестье, воинское соединение, потерявшее знамя рассформировывается. Низложенное знамя (брошенное к ногам победителей) навсегда теряет свой статус.
Вот и легли самые значимые и кайзеровские, и вермахтовские, тем более гитлеровские на помост.
Историки отмечают, когда до германских военнопленных, что у нас, что у союзничков, дошла информация о низложении германских знамен на Параде Победы, боевой дух и настрой скатился до нуля.

Знамена поверженного врага, брезгливо швыряемые к подножию мавзолея - СИЛЬНЫЙ ход!