Изучать русский язык по транскрипции, это всё-равно, изучать математику используя римские цифры.

Копипаст, но по теме:
Итак, зачем «мучить» детей фонетикой с начальной школы? А затем, что в школе изучают русский язык как науку. Поэтому придется мне сейчас немного терминологии употребить, потерпите немного. Дети с первого класса занимаются языковедением, изучая лексику, фонетику, графику, морфемику, морфологию, грамматику, синтаксис, стилистику, семантику, этимологию, орфографию, пунктуацию, устную и, главное, – письменную речь. Ключевое слово – письменную.

Если бы в школе учили только говорить и заниматься устным творчеством – no problem, можно было бы обойтись и без многих вышеназванных разделов. И без фонетики в первую очередь. Почему в первую? А вы посмотрите, с чего начинается изучение любого иностранного языка? Именно с фонетики и транскрипции. Вы скажете: «У-у-у, так то иностранный язык. Ему учиться надо. А на своем-то мы и так говорить умеем, спасибо папе с мамой».

Так в школе и учат русскому языку, а не просто разговорной речи. Поэтому и начинают с фонетики: с гласных, согласных (звонких, глухих, твердых, мягких, сонорных, шипящих, свистящих), слогов, ударения, сильных и слабых позиций звуков. Причем эта премудрость начинается уже в добуквенный период в 1-м классе – в первые две недели сентября. Дети еще ни одной буквы, ни одного слова не встретили на страницах букваря, а уже разбирают слова на фонемы.

Зачем и почему так рано? Затем, что фонетика первична по отношению к написанию. Потому что с 90-х годов прошлого столетия ведущим принципом орфографии (правописания) стал именно фонематический принцип. Он гласит: одна и та же буква обозначает фонему в сильной и слабой позициях. Фонема – звук-смыслоразличитель (дом – том, бык – бак). В одной и той же части слова (морфеме) пишется одна и та же буква, независимо от произношения: снеГ – снеГа, кОтята – кОт, на конЕ – на деревЕ. 85–90 % правил правописания слов в русском языке основано на фонематическом принципе.