Хохлатые макаки потихоньку вымирают. Они полностью истреблены на острове Лембех, а на трёх оставшихся — Сулавеси, Манадотуа и Талисе — встречаются всё реже. Животные страдают от уничтожения тропических лесов, их мясо считается деликатесом, поэтому численность животных постоянно сокращается.
